59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11485 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 261 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  81.01 
 
 		 258 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  80.38 
 
 		 259 aa  346  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  80.62 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  80.62 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  82.38 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  63.37 
 
 		 274 aa  274  9e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  64.89 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  47.64 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  43.37 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  46.67 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  47.98 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  45.53 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  45.49 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  43.33 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  41.57 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.53 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  43.72 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  41.88 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  39.76 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.4 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  45.12 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.38 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  41.53 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  38.13 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  42.8 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  44.54 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  44.68 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  44.84 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  39.42 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  34.67 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  34.51 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  26.05 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  28.17 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.45 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 		 339 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  21.89 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 360 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 270 aa  42  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 		 244 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 256 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>