64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2729 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 259 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  89.92 
 
 		 259 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  86.38 
 
 		 258 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  85.6 
 
 		 258 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  85.6 
 
 		 258 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  82.38 
 
 		 261 aa  364  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  67.97 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  64.75 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  51.95 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  46.31 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  46.35 
 
 		 268 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  44.71 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  49.77 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  46.64 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  47.01 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  45.52 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  43.36 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  44.13 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  45.02 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.56 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  41.38 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  43.67 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  41.47 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.44 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.87 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  44.98 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  41.57 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  45.34 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  43 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  46.78 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  43.75 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  33.33 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 366 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.42 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  22.97 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  31.3 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.33 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  22.97 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.81 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  26.15 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  22.52 
 
 		 244 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  22.07 
 
 		 244 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  22.07 
 
 		 244 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  22.52 
 
 		 244 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  22.52 
 
 		 244 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>