More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3623 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 280 aa  557  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  90.36 
 
 		 280 aa  517  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  52.94 
 
 		 285 aa  271  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  51.92 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  55.51 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  47.33 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  53.28 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  49.31 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  47.64 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  48.11 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  46.89 
 
 		 279 aa  225  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  48.67 
 
 		 284 aa  221  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  44.83 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  49.41 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.03 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  32.95 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.33 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  23.11 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  22.64 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.38 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  28.57 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.19 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  25.85 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  28.5 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  29.91 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  23.98 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.45 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  29.08 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  29.08 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  29.08 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  29.08 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  29.45 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.59 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  28.38 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.1 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  28.17 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  27.4 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.93 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 413 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>