89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13310 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 245 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  54.39 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  55.37 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  52.67 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  48.33 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  48.76 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  50.42 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.33 
 
 		 264 aa  174  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  47.86 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.49 
 
 		 266 aa  165  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  48.35 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  45.87 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  47.52 
 
 		 279 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  50.64 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  50.64 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.56 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  50.21 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  47.83 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  53.59 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  50.21 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  46.81 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.94 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  42.92 
 
 		 274 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  45.45 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  49.58 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  48.55 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  44.18 
 
 		 269 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.19 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  44.77 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  51.18 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  36.97 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  35.57 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.44 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.29 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.39 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 		 267 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.5 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.38 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.91 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.62 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.36 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  28.44 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  25.85 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.91 
 
 		 319 aa  42.4  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 		 341 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>