55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2477 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  100 
 
 		 258 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 258 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  98.84 
 
 		 258 aa  477  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  87.01 
 
 		 259 aa  362  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  85.6 
 
 		 259 aa  354  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  80.62 
 
 		 261 aa  353  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  66.02 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  62.69 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.68 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  48.83 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  45.83 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  50.23 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  43.44 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  46.06 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  46.8 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  44.76 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  47.41 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  46.49 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  51.71 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  41.76 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  45.88 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.86 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  45.97 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  39.15 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.64 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  41.22 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  47.48 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  42.51 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  43.75 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  43.35 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  39.72 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 281 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  32.64 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  32.74 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  32.59 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 360 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 339 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  22.47 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>