239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2966 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 279 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  67.98 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  66.02 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  66.8 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  60.56 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  62.45 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  65.22 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  54.15 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  51.91 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  48.21 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  47.97 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.84 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  53.78 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.34 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  43.25 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  49.4 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  54.29 
 
 		 257 aa  159  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  43.96 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.53 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  46.89 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  46.03 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.54 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.35 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  43.85 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.01 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  47.41 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.41 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  43.36 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.42 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.43 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  48.16 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  47.26 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  43.57 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 		 360 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 		 339 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  31.79 
 
 		 360 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.63 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.17 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.02 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 367 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.13 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.89 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.22 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  29.03 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.9 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.73 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.88 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.99 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.14 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  22.38 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  21.7 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  27.62 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  28.38 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  23.93 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>