More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  69 
 
 		 285 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  63.93 
 
 		 281 aa  333  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  63.35 
 
 		 279 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  55.87 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  50.7 
 
 		 280 aa  268  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  51.76 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  46.5 
 
 		 280 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  56.65 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  45.69 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  46.57 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  41.75 
 
 		 306 aa  221  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  44.91 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  43.45 
 
 		 284 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  38.24 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.19 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  34.03 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.85 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  32.73 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  27.18 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  33 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.62 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.1 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  29.64 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  28.36 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.29 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.86 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.12 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.89 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  26.9 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.32 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  25.12 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  27.09 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  28.85 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  31.95 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  31.16 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  28.74 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.81 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.44 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  24.39 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  31.54 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  26.48 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>