110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0887 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  53.3 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  53.3 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  35.74 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  34.47 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  34.47 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  34.47 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  34.47 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.62 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  31.98 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.61 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  22.59 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 443 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  24.79 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  22.22 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.62 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  24.27 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  21.93 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.64 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.39 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  21.65 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25.87 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  27.91 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 358 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  24.38 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 427 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  21.08 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  20.1 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 366 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  21.03 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  20.5 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  21.12 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  25.48 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  22.77 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.61 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  18.45 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 413 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  23.56 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 372 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  19.32 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  23.76 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.28 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 398 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  21.85 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  18.27 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 341 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  23.03 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  20.18 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>