42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1266 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  47.33 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  34.02 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  36.03 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.87 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  26.64 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  26.64 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  27.05 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  26.64 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  26.64 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  30.47 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2296  hypothetical protein  45.78 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  26.79 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  24.08 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  19.67 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  19.67 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  30 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  33.68 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>