97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0185 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 265 aa  518  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  31.06 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  31.06 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  31.06 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  31.06 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  31.06 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.59 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.43 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  28.95 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  25.42 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.4 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  27.47 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.62 
 
 		 146 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.85 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2551  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 508 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.644772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  23.62 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 366 aa  53.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 358 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 371 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.52 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 371 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.34 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.98 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0531  ABC transporter permease  26.37 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.87 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  24.12 
 
 		 381 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  24.06 
 
 		 378 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  26.18 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  24.06 
 
 		 378 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  24.71 
 
 		 381 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 993 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 993 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.89 
 
 		 359 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  37.88 
 
 		 255 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  25.93 
 
 		 234 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  22.87 
 
 		 366 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  25.93 
 
 		 234 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  23.4 
 
 		 366 aa  42  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  25.93 
 
 		 234 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  26.88 
 
 		 251 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>