56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0309 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.15 
 
 
245 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 
243 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 
243 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 
243 aa  125  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 
244 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 
244 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  31.17 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  31.58 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  31.58 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  31.8 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  31.8 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
244 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.44 
 
 
241 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  23.2 
 
 
276 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  21.99 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.77 
 
 
146 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
341 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.14 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 
366 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 
368 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
368 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2296  hypothetical protein  29.36 
 
 
103 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 
413 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  21.63 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
368 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  22.52 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 
344 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
252 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>