36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1292 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  43 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  28.16 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  28.57 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  28.57 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  28.16 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.67 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  34.52 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 378 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 443 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.89 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.71 
 
 		 261 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 378 aa  42  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>