More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3574 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 443 aa  864    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  32.02 
 
 		 244 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  32.4 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.22 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.38 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 243 aa  67  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.4 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.18 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.69 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.29 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.88 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  21.08 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.16 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  20.26 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.21 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  25.41 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.32 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.73 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  24.42 
 
 		 256 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.42 
 
 		 276 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  24.62 
 
 		 371 aa  57  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  27.92 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  28.08 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 247 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  20.65 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.93 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  29.13 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 246 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 267 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  20 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 259 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 358 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 287 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  29.84 
 
 		 370 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  25.7 
 
 		 269 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 274 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 370 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  19.1 
 
 		 413 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  28.27 
 
 		 261 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  24.86 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 370 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  26.75 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.5 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  26.75 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  26.75 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  24.83 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  29.49 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>