294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9333 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  55.92 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  45.08 
 
 		 231 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  43.39 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  44.26 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  38.84 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  40.34 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  37.2 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 267 aa  111  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  46.15 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 360 aa  98.6  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 339 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 375 aa  95.5  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 360 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 443 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 366 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.2 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.2 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 381 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.05 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  31.61 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.83 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.07 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  30.32 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  29.25 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.15 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  30.39 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  25.86 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.7 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.7 
 
 		 379 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.73 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.26 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  24.62 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  22.67 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 336 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  26.88 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.64 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.53 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  28.12 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.77 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  26.92 
 
 		 382 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>