More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5840 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 367 aa  740    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  53.41 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.23 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.1 
 
 		 261 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 		 327 aa  90.1  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  24.12 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  23.85 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  30.3 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 241 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 256 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  29.35 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.16 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  22.92 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.96 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  21.47 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  21.39 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  21.88 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  20.05 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 249 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  20.45 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  24.38 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  23.57 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  22.25 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  22.37 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  30.9 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  21.31 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25.11 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  23.72 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  25.63 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  20.82 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  23.72 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  23.72 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  19.95 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.08 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  24.24 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  22.53 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  19.26 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  30.27 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  23.93 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.74 
 
 		 249 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  21.41 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  23.99 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  21.26 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  26.97 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  23.5 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.5 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.5 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>