More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1667 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  39.15 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0991  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 358 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 341 aa  68.6  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.88 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 366 aa  58.5  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  29.58 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.31 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  24.61 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  21.27 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 368 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 378 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.89 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  25.74 
 
 		 368 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  25 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  25 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  25 
 
 		 368 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.39 
 
 		 379 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  30.97 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 286 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 360 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 304 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.92 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  26.29 
 
 		 377 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  21.23 
 
 		 370 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 369 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  26.32 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 		 339 aa  52  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  27.23 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 368 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  20.65 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 365 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.99 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  26.14 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  26.13 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 372 aa  50.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.95 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  23.78 
 
 		 365 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>