262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3044 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  100 
 
 
269 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
244 aa  89  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  30.66 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  30.19 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  30.19 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 
244 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  30.19 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  30.19 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 
375 aa  75.5  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.64 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.36 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.02 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.5 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.82 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 
358 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  27.69 
 
 
363 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  27.69 
 
 
363 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  27.69 
 
 
363 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  27.69 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  27.69 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.49 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  27.69 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  24.47 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  26.88 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 
238 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  33.64 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  25.93 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  25 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  24.69 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  22.7 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  26.86 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 
367 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 
250 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 
363 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  24.63 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  24.37 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 
263 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 
256 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 
270 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  22.9 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.12 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  24.34 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  27.17 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>