166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1451 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  508  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
241 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  28.65 
 
 
374 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  28.65 
 
 
356 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
358 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  27.54 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.54 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  27.97 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  27.54 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.51 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.68 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  26.7 
 
 
371 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 
327 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0077  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
352 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 
368 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25 
 
 
375 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.23 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
369 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  29.89 
 
 
369 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 
376 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
291 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 
368 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
368 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  28.77 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.82 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 
344 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 
398 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  28.71 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  23.62 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  23.62 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 
367 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
367 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  23.96 
 
 
254 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
296 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  30 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  27.85 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  27.88 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
372 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
378 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 
376 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 
376 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
388 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.09 
 
 
365 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  28.93 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  25.13 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.61 
 
 
370 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.23 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  25 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  27.4 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 
341 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 
288 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
366 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 
251 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  28.57 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  28.57 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 
371 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  28.57 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  28.57 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  28.57 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 
370 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.57 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  26.98 
 
 
284 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  22.22 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.14 
 
 
379 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 
339 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  27.33 
 
 
378 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
369 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 
368 aa  45.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 
365 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 
390 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>