16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0077 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0077  ABC-2 type transporter  100 
 
 
352 aa  716    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  19.87 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  18.53 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  17.94 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  18.82 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1842  ABC transporter, permease protein  18.4 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.737626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1662  ABC transporter permease  17.94 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1794  ABC transporter permease  17.94 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  18.24 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  18.95 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  17.94 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  17.94 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  32.03 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2624  ABC-2 type transporter  25 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>