274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1407 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 390 aa  756    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.93 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.38 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  22.22 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  22.22 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  20.57 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  20.41 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  21.41 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  26.55 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  21.5 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  20.57 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  22.76 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.54 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  25.48 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.73 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  21.3 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.38 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  36.77 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  26.29 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.98 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.88 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  23.15 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.34 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  20.72 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1035  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.91 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.03 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  23.34 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  24.24 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.32 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  26.1 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 263 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 264 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 293 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1446  ABC-2 type transporter  33.01 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.145577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.17 
 
 		 251 aa  53.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 269 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  28.29 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 297 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  24.63 
 
 		 374 aa  53.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  24.15 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  23.26 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.59 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  23.95 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  21.25 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  27 
 
 		 691 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.8 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  25.48 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.02 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  23.42 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 286 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>