56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0764 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  100 
 
 
269 aa  527  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 
267 aa  246  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 
267 aa  230  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 
270 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 
270 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 
413 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  25 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  25 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 
281 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1930  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1602  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.863835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.34 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.57 
 
 
370 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.32 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 
370 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.08 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  26.28 
 
 
376 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 
993 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 
993 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
381 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 
241 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  24.78 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  24.34 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 
368 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 
390 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
373 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
366 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
377 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 
365 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.29 
 
 
370 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.16 
 
 
384 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
372 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  27.05 
 
 
365 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 
375 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  22.41 
 
 
226 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.43 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>