60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0870 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 267 aa  520  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  60.67 
 
 		 267 aa  328  7e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1137  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.18489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  30.85 
 
 		 365 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 365 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.92 
 
 		 369 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  31.91 
 
 		 365 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1930  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  27.14 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 381 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.73 
 
 		 370 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 413 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 363 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  27.31 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  20.44 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  27.64 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  27.64 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.88 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.6 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  34.34 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 368 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.3 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 372 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  23.91 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  25.48 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 379 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  29.2 
 
 		 273 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 286 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 255 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>