166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1805 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  63.33 
 
 		 275 aa  318  7e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  63.94 
 
 		 275 aa  314  9e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  44.96 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  43.96 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  45.1 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  45.1 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.39 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  34.44 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.03 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.91 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.96 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.59 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.12 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  31.21 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.3 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.95 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.47 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  26.24 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.38 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.92 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  29.86 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  21.31 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  28.16 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 290 aa  48.9  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  24.66 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  28.21 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  28.05 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0009  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.29 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.92 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  28.05 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  27.88 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  24.88 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.34 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0525  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127264 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.29 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  28.99 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  24.39 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  24.39 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  25.62 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>