20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0525 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0525  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21550  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.996492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0230  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0145585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1399  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4137  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000402525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 371 aa  45.8  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  32.56 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  24.31 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  29.63 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0437  hypothetical protein  24.11 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4309  hypothetical protein  26.2 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>