79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1478 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  60.08 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  27.53 
 
 		 921 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 370 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 378 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0436  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1474  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  25.95 
 
 		 370 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  23.16 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  23.16 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  23.16 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 370 aa  45.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  27.43 
 
 		 927 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  23.16 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  24 
 
 		 936 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  25.17 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  23.16 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  24 
 
 		 936 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1137  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.18489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.16 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  30 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  24.65 
 
 		 691 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  30 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  34.62 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  25.97 
 
 		 930 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  29.92 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  30 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 		 376 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1007  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.200229  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  21.84 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 369 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  25 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  22.6 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  21.71 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  21.71 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  21.71 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  25.74 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0525  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  25.7 
 
 		 914 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  22.76 
 
 		 373 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0291  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  25.41 
 
 		 346 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  21.6 
 
 		 281 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  24.16 
 
 		 1079 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  24.16 
 
 		 1066 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 371 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  24.16 
 
 		 1071 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  24.16 
 
 		 1082 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  24.16 
 
 		 1071 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  24.58 
 
 		 926 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  24.16 
 
 		 1089 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 377 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  21.14 
 
 		 373 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>