25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0291 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0291  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 254 aa  495  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1144  ABC-2 type transporter  47.06 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  26.79 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1410  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  26.1 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143094  unclonable  2.44279e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0330  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0869  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.201874  normal  0.150559 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.9 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  27.24 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  24.43 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  23.13 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 427 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 368 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 418 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 371 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>