16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1336 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  100 
 
 
253 aa  503  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  27.71 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0869  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 
260 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.201874  normal  0.150559 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3025  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 
274 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.019296 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0698  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
276 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  30.2 
 
 
276 aa  99  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2274  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1410  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  25.38 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143094  unclonable  2.44279e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0330  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0988  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  27.37 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0291  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00350  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1144  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>