14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3260 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  509  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  46.9 
 
 
276 aa  201  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0869  ABC-2 type transporter  36.58 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.201874  normal  0.150559 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0698  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 
276 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3025  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.019296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2274  ABC-2 type transporter  41.96 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1410  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  21.96 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143094  unclonable  2.44279e-28 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0988  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 
250 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281935  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0291  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  28.5 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>