18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2330 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 256 aa  484  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3025  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.019296 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0869  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.201874  normal  0.150559 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1410  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  30 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143094  unclonable  2.44279e-28 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0698  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  31.13 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2274  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  30.23 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0988  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0330  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  31.58 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00350  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0291  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1144  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>