160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3320 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.8 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 372 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.72 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.14 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.38 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  26.11 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 371 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.89 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.91 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.44 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  40.35 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.44 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  25.14 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 377 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.83 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 339 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  38.6 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.55 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  28.65 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  28.65 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 379 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  28.65 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  26.5 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  28.65 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.46 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  22.87 
 
 		 365 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  24.87 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.74 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  25.85 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  21.81 
 
 		 365 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  24.86 
 
 		 377 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  24.11 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  24.11 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 		 377 aa  45.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.87 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.75 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  22.68 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.39 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4309  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>