170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1954 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  100 
 
 
275 aa  543  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  91.27 
 
 
275 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  63.94 
 
 
290 aa  326  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  45.99 
 
 
279 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 
273 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  45 
 
 
281 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  44.25 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  44.06 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.05 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 
294 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 
261 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.12 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.39 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.39 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.24 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.51 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  31.77 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 
304 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  30.94 
 
 
256 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 
245 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  28.74 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.32 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 
375 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.38 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 
241 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
377 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 
374 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.07 
 
 
249 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.9 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1603  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  29.19 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  26.03 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.76 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 
443 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
378 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.99 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  26.79 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  32.1 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
241 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
378 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  29.93 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  25 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  26.72 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  28.12 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0009  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 
232 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.86 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.37 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1399  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 
363 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  27.7 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  31.29 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.7 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 
251 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 
360 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
372 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.67 
 
 
226 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
356 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.53 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.83 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  31.18 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  25 
 
 
269 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  27.38 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>