87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4309 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4309  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1474  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 368 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 374 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 384 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.99 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.14 
 
 		 368 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0525  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 312 aa  52.4  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 378 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  26.57 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  26.57 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  26.8 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  26.57 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  26.57 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  26.57 
 
 		 368 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 368 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.76 
 
 		 382 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  28.1 
 
 		 384 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.26 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.33 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.68 
 
 		 376 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.81 
 
 		 384 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.74 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.96 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 370 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21550  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.996492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  25.79 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  31.69 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.9 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.67 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 378 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  26.8 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.72 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.4 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  23.81 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.71 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 363 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0230  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0145585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  24.47 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  30.99 
 
 		 691 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1007  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.200229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 377 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.32 
 
 		 381 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.28 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  27.14 
 
 		 385 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 391 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.22 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 378 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 391 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.38 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.28 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 387 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 369 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  27.72 
 
 		 284 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>