More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0530 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 		 243 aa  214  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  36.71 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  42.25 
 
 		 244 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  38.2 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  26.85 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  27.78 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  26.85 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  27.31 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.44 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  27.31 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  28.7 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25.1 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  30.95 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  29.15 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  28.38 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  31.43 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  28.44 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  28.34 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.33 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  29.38 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  29.38 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  27.97 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  27.97 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  27.97 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  27.97 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  27.97 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  26.96 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  25.9 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  29.17 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.83 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  29.08 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.99 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  25.82 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  29.08 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.85 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.3 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>