More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2356 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 286 aa  564  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  94.41 
 
 		 286 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  65.47 
 
 		 281 aa  356  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  54.21 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  52.48 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  44.1 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  46.15 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  43.45 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.02 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.13 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.42 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.6 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.13 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  26.62 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  28.8 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  29.76 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.79 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  24.7 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.82 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  26.38 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.32 
 
 		 370 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 368 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.2 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.68 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  26.59 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  28.08 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.88 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  27.75 
 
 		 376 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 376 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.45 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 380 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 380 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  21.9 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 372 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  27.1 
 
 		 369 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 369 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  31.61 
 
 		 370 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.17 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 378 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 370 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.29 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.17 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.07 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  30.56 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1930  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.46 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>