More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4575 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 370 aa  756    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  30.03 
 
 		 366 aa  169  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  23.36 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  22.43 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  22.55 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  22.55 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  22.55 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  22.55 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 369 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.19 
 
 		 381 aa  99.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  22.55 
 
 		 368 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  21.73 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.87 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.5 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 367 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  21.82 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  25 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.67 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.77 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.04 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.49 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.34 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  23.68 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  24.42 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  21 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.8 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  20.11 
 
 		 375 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  21.12 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  22.37 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  23.85 
 
 		 691 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.92 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.81 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.56 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  21.68 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.87 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.29 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  21.58 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  21.56 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  23.1 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.98 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  22.25 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.74 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  23.96 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.71 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.96 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.58 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  23.96 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  23.96 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  23.96 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  23.96 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>