85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2878 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0009  ABC-2 type transporter  45.3 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  32.48 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.26 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.47 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.57 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.08 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.33 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.84 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 281 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.84 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.9 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.86 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  24.69 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.32 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.42 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.83 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  28.03 
 
 		 375 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  23.46 
 
 		 260 aa  45.8  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.01 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.38 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.77 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  26.67 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  26.67 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.92 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.78 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  25.13 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  26.6 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 254 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.83 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.08 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 369 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>