109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3318 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.55 
 
 		 381 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  27.18 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  31.87 
 
 		 376 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.18 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  29.14 
 
 		 383 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 368 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 372 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 281 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.51 
 
 		 384 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 370 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  27.33 
 
 		 1071 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  27.33 
 
 		 1082 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 		 921 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  27.33 
 
 		 1071 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  27.33 
 
 		 1066 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  27.33 
 
 		 1079 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 383 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 383 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.48 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.25 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  30.6 
 
 		 1089 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  27.91 
 
 		 378 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  27.73 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  25 
 
 		 346 aa  49.7  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 377 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  29.48 
 
 		 942 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 388 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  28.9 
 
 		 936 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 387 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  25.16 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  25.16 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  25.16 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  26.9 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  28.75 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  21.95 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  24.53 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  24.53 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  24.15 
 
 		 378 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.83 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 370 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 376 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  29.23 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.92 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  35.92 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  29.48 
 
 		 936 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  29.48 
 
 		 936 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 371 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 375 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  28.09 
 
 		 376 aa  45.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  23.2 
 
 		 371 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  24.88 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  25.25 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  28.74 
 
 		 927 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  26.62 
 
 		 919 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 339 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.74 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.84 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 384 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  34.62 
 
 		 691 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  24.35 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  26.06 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  25.29 
 
 		 371 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  25.47 
 
 		 918 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>