238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1006 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  24.43 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  28.82 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  30.38 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.16 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  24.46 
 
 		 1106 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.23 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.71 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0229  hypothetical protein  22.97 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0141288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21540  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.75 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.937683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0524  hypothetical protein  25.99 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000443046 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 370 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.11 
 
 		 365 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.43 
 
 		 914 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.2 
 
 		 379 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  26.37 
 
 		 376 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 378 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 378 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.7 
 
 		 375 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.63 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 380 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 383 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 384 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 		 385 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 376 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.57 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 378 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  28.31 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  27.54 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.81 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  22.35 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 383 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.99 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 		 366 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  23.87 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  25.47 
 
 		 377 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  26.04 
 
 		 383 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.43 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 378 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.21 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 376 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 388 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 368 aa  48.9  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.03 
 
 		 382 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 376 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 374 aa  48.9  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 366 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  26.52 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  29.34 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  27 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  29.34 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.09 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  22.77 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  21.95 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>