42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1477 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1602  ABC-2 type transporter  63.81 
 
 
268 aa  319  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.863835  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  25 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  25 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  25 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
270 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.43 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  27.14 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  26.63 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.88 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.88 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 
289 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 
253 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.53 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.3 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.26 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  20.85 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.7 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0009  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  31.41 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.45 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  23.9 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.4 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 
290 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.54 
 
 
255 aa  42  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>