More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1576 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  45.18 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  35.87 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  44.93 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  34.67 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  41.25 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  40.76 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.35 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 378 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  26.53 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.19 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.19 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.97 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  25.51 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.1 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.66 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  25.13 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25.91 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  31.1 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  27.95 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.14 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  27.14 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.35 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  28.06 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  28.06 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  28.06 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  29.38 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  28.06 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 384 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.61 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 384 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 443 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  25.63 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.03 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.28 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  27.31 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 387 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.61 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  28.93 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  31.29 
 
 		 369 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.95 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.47 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.93 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  32.03 
 
 		 379 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  29.81 
 
 		 385 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>