More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0094 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 388 aa  766    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.72 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  21.68 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.69 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.72 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  26.29 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.16 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.11 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  26.52 
 
 		 244 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.99 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  21.24 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.29 
 
 		 232 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  20.87 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  24.51 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.12 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.19 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.54 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  31.07 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.97 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  24.4 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  20.26 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  22.33 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  24.18 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  20.39 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.14 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 		 260 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  20.35 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 241 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  22.33 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  19.95 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  23.38 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.96 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 255 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.96 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 241 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.15 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  22.02 
 
 		 259 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 260 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 281 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 256 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5172  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 247 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 253 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  21.76 
 
 		 257 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  21.76 
 
 		 257 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 231 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 249 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>