More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0608 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 281 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  63.37 
 
 		 285 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  65.27 
 
 		 285 aa  329  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  62.54 
 
 		 279 aa  315  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  58.24 
 
 		 278 aa  285  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  49.82 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  49.31 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  46.49 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  43.28 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  46.24 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  50.76 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  43.07 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  42.48 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.74 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  34.74 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  36.32 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  35.16 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.34 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 366 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 375 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 		 360 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 261 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.57 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  30.43 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.81 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  31.06 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  26.12 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  25.69 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.5 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  24.9 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  28.57 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  27.95 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.64 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.13 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  27.33 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  26.6 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  28.4 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  27.45 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  29.44 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.77 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  25.37 
 
 		 377 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  27.32 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  30.25 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 443 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  28.57 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.99 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  27.95 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  23.28 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>