More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1264 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 244 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  62.23 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  41.6 
 
 		 243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  39.72 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  39.17 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.67 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  35.35 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  30.04 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  30.04 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  30.2 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.55 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.55 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  28.38 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  30.05 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  29.82 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.86 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  29.7 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  27.35 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.99 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  30.9 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.06 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 188 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  27.78 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.99 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  28.3 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  30.99 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.69 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.12 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  30.37 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  31.32 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  30.41 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  25.7 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  29.36 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  28.39 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.36 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  30.05 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  29.38 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  27.72 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.14 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.32 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  31.92 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  26.99 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  27.08 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.44 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  28.45 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  27.19 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>