More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1483 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  100 
 
 		 254 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  52.02 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.43 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.42 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  46.96 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  46.4 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  45.31 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  47.26 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  46.77 
 
 		 285 aa  201  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  46.22 
 
 		 284 aa  198  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  46.94 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  47.01 
 
 		 289 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.78 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  44.53 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  49.78 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  44.53 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.44 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  44.53 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  47.21 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  44.16 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  44.16 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  46.7 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  48.48 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  43.33 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  44.17 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.3 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.3 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  42.8 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  42.97 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  45.76 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  44.14 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  42.74 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  42.74 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  42.74 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  42.74 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  40.65 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  42.74 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  42.74 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  42.74 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  42.67 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  40.52 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  46.55 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  42.86 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  42.86 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  41.7 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  45.92 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.33 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  43.05 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  41.6 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  45.26 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  36.33 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  41.12 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  41.46 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  41.96 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  41.96 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  39.06 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  45.58 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  39.91 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  39.44 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  36.4 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  34.41 
 
 		 269 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  36.11 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.19 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.61 
 
 		 622 aa  109  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  35.65 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 269 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  33.14 
 
 		 199 aa  92  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  32.91 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  34.06 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  32.9 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.88 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.17 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.65 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.25 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  32.99 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.1 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.92 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.65 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>