More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4165 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  100 
 
 		 256 aa  500  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  62.35 
 
 		 261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  56.63 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  57.03 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  54.44 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  52.99 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  54.22 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  52.21 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  54.51 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  51.78 
 
 		 280 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  55.82 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  55.82 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  55.42 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  55.82 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  52.42 
 
 		 273 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  53.23 
 
 		 275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  58.04 
 
 		 273 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  53.82 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  51.2 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  58.87 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  51.21 
 
 		 269 aa  254  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  55.42 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  51.82 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  53.63 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  55.02 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  55.02 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  49.19 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  51 
 
 		 277 aa  248  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  58.01 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  49.6 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  54.36 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.47 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  50.81 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  44.76 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.88 
 
 		 262 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  48.52 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  50.21 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.21 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  50.62 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  46.96 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  47.3 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  43.7 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  37.3 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  37.3 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  38.55 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  37.85 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  41.3 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  32.93 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 		 276 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  34.88 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.79 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.25 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  32.02 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  27.45 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.84 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  27.91 
 
 		 622 aa  82  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.35 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.23 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.62 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  28.92 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>