295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1175 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  54.79 
 
 		 276 aa  275  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  48.88 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  49.81 
 
 		 622 aa  240  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  47.08 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  45.8 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  45.27 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 265 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  46.25 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  44.66 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  50.79 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  32.43 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  38.59 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  38.77 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  33.91 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  35.37 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  33.2 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  31.02 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  30.56 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  35.94 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  31.69 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.89 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  33.89 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  35.29 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  31.03 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  31.75 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.89 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.17 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.41 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30.45 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  29.82 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.96 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  33.2 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  35.47 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  29.55 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  33.33 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  29.81 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.95 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  29.3 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  32.79 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.82 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.82 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.02 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  32.02 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  32.1 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.12 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.52 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  33.18 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  30.74 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  30.74 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  30.74 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  30.74 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  30.74 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  28.85 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  30.74 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.85 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  30.74 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.45 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  33.18 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  32.94 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  28.85 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  28.19 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  29.28 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  32.02 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  33.01 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  31.53 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  30.26 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  30.26 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  30.26 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  30.7 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.22 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  30.7 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.97 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  32.65 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2013  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  25.63 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.25 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>