232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1803 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  49.24 
 
 		 278 aa  212  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  48.12 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  38.17 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.76 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  38.95 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  39.01 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  42.65 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.14 
 
 		 622 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  34.4 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.98 
 
 		 266 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  36.95 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  37.22 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  33.46 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  32.64 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  32.23 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.39 
 
 		 269 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  32.41 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  34.65 
 
 		 267 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.26 
 
 		 275 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 268 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.5 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  36.79 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  28.96 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 199 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  32 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.61 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  30.83 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.24 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  30.8 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  35.89 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  32.03 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  36.02 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.17 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  30.16 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  36.49 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  31.25 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  34.93 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.72 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  34.93 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  30 
 
 		 271 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  35.24 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  30.68 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  30.68 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30.47 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  30.68 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  35.24 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  35.24 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  30.68 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  30.68 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  30.68 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  30.68 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.3 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  33.49 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  33.08 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.65 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  27.67 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.71 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  29.65 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  33.19 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  28.3 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  33.66 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  30.6 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.6 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.57 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.35 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.86 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  30.09 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  33.51 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.32 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.65 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.32 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.24 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.32 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.52 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.94 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.62 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.41 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>