227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1802 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 265 aa  517  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  51.98 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  51.98 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  47.6 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  49.61 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  47.39 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  42.29 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.74 
 
 		 622 aa  202  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  42.59 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  37.18 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  36.79 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  35.38 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  34.91 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.45 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.5 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.78 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  31.98 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  31.14 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  30.2 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  29.58 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.04 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  30.23 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  28.81 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.49 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  32.31 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.31 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  30.1 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.1 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.68 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.94 
 
 		 281 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  34.55 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  33.01 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  32 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  29.96 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  30.1 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  32 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.3 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  31 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30.84 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  30.58 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  29.18 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  30.36 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  30 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  28.64 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  28.87 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  29.69 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  26.8 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  27.43 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.25 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.25 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.86 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  26.4 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  26.4 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  26.4 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  26.4 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  26.4 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  26.4 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  26.4 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.42 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  28.42 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  28.42 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  28.42 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  26.84 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  26.96 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  26.96 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.82 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.88 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.05 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  26.04 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  29.01 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.9 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.85 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.13 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>