More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2517 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  55.69 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  55.65 
 
 		 261 aa  275  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  53.82 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  53.17 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  48.64 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  40.56 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  41.53 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  42.59 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  42.59 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  43.06 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  37.05 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  44.35 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  45.89 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  44.81 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  41.3 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  37.7 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  38.31 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.1 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  43.27 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  43.19 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  37.65 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  42.11 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  44.39 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  44.39 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  37.16 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  34.43 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.68 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  37.16 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.16 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  36.7 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  37.55 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  37.38 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  39.81 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  34.84 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  39.81 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  37.86 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.84 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  35.66 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.9 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  33.61 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  33.61 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  33.61 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  33.61 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  35.66 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  33.61 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  33.61 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  33.61 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.22 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  35.53 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  37.8 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  33.2 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  35.25 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  35.25 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  35.25 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  36.8 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  36.99 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.44 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  36.32 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  33.91 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  35.32 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  35.08 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.86 
 
 		 622 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  32.92 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.68 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.81 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.84 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.94 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.96 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  25 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.31 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  28.97 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  29.72 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>