229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1174 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 278 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  39.83 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  41.02 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.5 
 
 		 622 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  39.33 
 
 		 266 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  38.91 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.13 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  36.55 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  38.14 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.46 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  29.35 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  29.17 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  33.77 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  29.37 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  29.37 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  30.38 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  29.05 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  30.34 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  29.67 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  29.92 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  30.69 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.25 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  28.36 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.93 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  30.35 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.35 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.46 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  29.36 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  28.72 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  25.98 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.79 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  29.44 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  29.07 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.32 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  31.05 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  27.31 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  29.35 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  29.52 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  26.37 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  28.36 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  28.36 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  29.11 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  27.86 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  26.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.98 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  26.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.67 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  29.34 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  26.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  27.18 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  26.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  26.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  26.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  26.87 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  27.36 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.14 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.14 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  23.47 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.05 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.93 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  27.86 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  27.86 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  27.86 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  25.93 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.75 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.89 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.64 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  28.08 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>